בחודש מרס 2015 נערכה חפירת בדיקה באתר הכלקוליתי נחל יתיר 2 (הרשאה מס' 7234-A; נ"צ 190671-798/572329-409; איור 1), לקראת סלילת קטע 3 בכביש 6. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון חברת כביש חוצה ישראל, נוהלה על ידי ד' ייגורוב (וצילום שטח) בסיועם של י' אלעמור (מנהלה), ש' גל (GPS) ומ' קונין, א' האג'יאן ומ' קאהן (מדידות וסרטוט).
האתר, כשלושה קילומטרים ממזרח ליישוב תל שבע, נתגלה במהלך סקר חירום שנערך באזור נחל יתיר בשנים 1983–1984 (גוברין תשנ"ב). בחפירה שנערכה בשנת 1986 במרחק של כקילומטר אחד ממערב לנחל יתיר 2, נחשפו שרידי יישוב שזמנו תקופת הברזל 1 והתקופה הפרסית (גוברין תשנ"א).
נפתחו שני שטחים (B ,A).
שטח A (איורים 2, 3) נמצא על מדרון מתון של גבעה שלמרגלותיה, מדרום, יובל של נחל יתיר. בשטח של דונם אחד נפתחו ריבועים (4 × 4 מ') שחולקו חלוקה משנית (2 × 2 מ'). החפירה בהם העמיקה במפלסים של 10 ס"מ, עד לעומק מרבי של 33 ס"מ. תכולת הריבועים נופתה במלואה. בצפון האתר, בשכבת לס, נחשף מכלול עשיר של כלי צור שבו עשרות להבי מגל, גרעינים ופסולת סיתות (איורים 4, 5). כן נמצאו שברים של כלי חרס שרק את מקצתם אפשר לזהות. הממצאים מתוארכים לתקופה הכלקוליתית.
בשטח B, כ-200 מ' מצפון לשטח A, נחפרו שרידי סכר (L902 ,L901; איורים 6, 7). הסכר (W90), שכיוונו צפון-מערב–דרום-מזרח, בנוי מארבעה נדבכים של אבני ואדי בינוניות שדופנו בבטון מודרני. אופי הבנייה והעדר ממצא אינדיקטיבי מאפשרים לתארך את הסכר לעת המודרנית, כנראה לתקופת המנדט הבריטי.
אתר נחל יתיר 2 שזמנו התקופה הכלקוליתית שימש בעיקר להפקת כלי צור. העדרם של שרידי בנייה ומערכות תת-קרקעיות מעיד על אופיו העונתי. מיקומו בין שני ערוצי נחלים, לצד שדות פוריים ונוכחות בולטת של להבי מגל שסותתו מחומר גלם מקומי וזמין מרמזים כנראה לפעילות חקלאית.
גוברין י' תשנ"ב.
מפת נחל יתיר (139) (סקר ארכיאולוגי של ישראל). ירושלים.
גוברין י' תשנ"א. אתר נחל יתיר – מולדה שבנחלת שבט שמעון? עתיקות20:*13–*23.