בחודש מרס 2006 נערכה חפירת הצלה בכפר דניאל (הרשאה מס' 4753-A*; נ"צ — רי"ח 193715-27/649281-91; רי"י 143715-27/149281-91) בפרויקט הרחבת תוואי כביש 10. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון מע"צ, נוהלה על ידי ע' עזב, בהשתתפות א' בכר (מנהלה), א' האג'יאן (מדידות), א' דגוט (מדידות GPS), מ' פיילשטוקר וע' ראם.
החפירה נערכה על מדרון צפוני מתון בו ניתן היה להבחין בשרידי ישוב קדום, שכללו בורות, קברים וחרסים מתקופות הברזל 2, ההלניסטית והרומית.
נחפר מקווה טהרה חצוב בסלע גיר קרטוני (3.8 × 4.2 מ', גובה 4.2 מ'; איור 1). הכניסה למקווה דרך פתח קמור (0.8 × 1.8 מ') וגרם מדרגות חצוב בסלע. ארבע מדרגות מכוסות בשכבת טיח הידראולי מובילות לאגן הטהרה. המדרגה הראשונה שחוקה (לוקוס 101), לאחריה מישורת (לוקוס 102; 1.4 × 2.0 מ'), מדרגות שנייה ושלישית (לוקוסים 103, 104; 0.5 × 1.2 מ') ומדרגה רביעית (לוקוס 105; 1.10 × 1.65 מ'), המשמשת משטח ירידה לאגן טהרה סגלגל (לוקוס 106; 2.4 × 4.0 מ'), קרקעיתו ודופנותיו מכוסים בשכבת טיח הידראולי עד לגובה 1.7 מ' ובדפנות , ניתן להבחין בתיקוני טיח. המקווה, הקרוב לקברים חצובים מימי הבית השני, השתמר היטב ונראה כי יש לייחסו לאוכלוסיית היישוב בפרק זמן זה.