בחודשים אוגוסט ואוקטובר 2002 נערכו חפירות באזור בית הקברות של שבי ציון (הרשאה מס' 3713-A*; נ"צ — רי"ח 20840-1/76561-2; ר"י 15840-1/26561-2), בעקבות עבודות פיתוח של מערכת הביוב ביישוב. החפירות, מטעם רשות העתיקות, נוהלו על ידי א' טצ'ר בהשתתפות א' שפירו, ו' אסמן וו' פירסקי (מדידות), ד' שיאון (מטבעות), י' לרר, ר' אבו-ריא, א' שטרן ונ' גצוב.
נפתחו שני שטחים: שטח A מצפון לבית הקברות ושטח B ממזרח לו.
שטח A
נפתחו שני ריבועי חפירה (4 × 3 מ' ו-5 × 5 מ') סמוך לגדתו הצפונית של נחל בית העמק כ-500 מ' לפני שפכו לים, ממערב לבית הקברות העתיק של שבי ציון (ח' אל-מלאחה) ומול בית הקברות המודרני של היישוב. כ-0.5 מ' מתחת לפני השטח נחשף קטע של רצפה מהודקת (15 × 40 מ') עשויה אבנים קטנות, חלוקי נחל, שברי חרסים, חול וחרסית אשר מתארה ומהותה לא הובררו. על הרצפה נמצאו מטבע שאינו ניתן לזיהוי, אך נראה שזמנו המאה הד' לסה"נ ושברי כלי החרס מן התקופה הרומית. מתחת לרצפה לא התגלה כל ממצא ארכיאולוגי.
שטח B
נפתח שטח (3 × 8 מ') ונחשף בו קטע קיר (6.3 מ' אורך; 1.3 מ' רוחב; 0.9 מ' גובה השתמרות) בנוי אבני גוויל קטנות ובינוניות ומשובצות בו לסירוגין אבנים מסותתות. לקיר פינה בקצהו המזרחי, שם הוא פונה דרומה, אולם המשכו לא נחפר. בין אבני הקיר נמצאו שברי כלי חרס, אבני פסיפס בינוניות ומטבע שאינו ניתן לזיהוי, אך נראה שזמנו המאה הה' לסה"נ. על פי החרסים ניתן לתארך את הקיר לתקופה הביזנטית.