בחודשים נובמבר–דצמבר 2005 נערכה חפירת הצלה מצפוו לתל כיסון (הרשאה מס' 4638-A; נ"צ — רי"ח 21400-25/7534-5; רי"י 16400-25/2534-5) בעקבות פגיעה. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון חברת החשמל, נוהלה על ידי נ' פייג בהשתתפות י' לבן וי' יעקובי (מנהלה), א' האג'יאן (מדידות) וה' סמיטליין (צילום).
נחפרו שני שטחים המרוחקים כ-20 מ' זה מזה (E ,D, כל אחד 7.5 × 5.0 מ'; איור 1), מצפון לתל וכ-150 מ' ממערב לחפירה קודמת (ר' חדשות ארכיאולוגיות 119).
בשטח D (איורים 2, 3) נחשפו ארבע שכבות.
בשכבה I מהתקופה ההלניסטית (המאות הד'-הג' לפסה"נ) נמצאה רצפת חלוקים גדולים ששרדה רק בחלק הצפוני-מזרחי של הריבוע (לוקוס 404).
בשכבה II מהתקופה הפרסית (סוף המאה הו'-המאה הד' לפסה"נ) הובחנו שני מפלסי רצפות בחלק הדרומי של הריבוע (לוקוס 403). לשכבה זו שייך גם לוקוס 402 והיא מתאפיינת בשפע כלי חרס הכוללים קערות, קנקנים מכל הסוגים וסירי בישול.
בשכבה III מתקופת הברזל 1 (המאה הי"א-אמצע המאה הי' לפסה"נ) נחשפה רצפה (לוקוס 413).
בשכבה IV מהתקופה הכלקוליתית (האלף החמישי לפסה"נ) נמצאו שברי קנקנים ללא שרידים אדריכליים. מתחת לשכבה נחשפה שכבה אלוביאלית חומה-צהבהבה, ללא חרסים, האופיינית לאזור.
בשטח E (איורים 4, 5) נחשפו שש שכבות.
שכבות II ,I מהתקופה ההלניסטית כללו קיר (W31) ששרד לגובה נדבך אחד ושתי רצפות. נחשפו שברי אמפורות רודיות ובהן שלוש ידיות חתומות.
בשכבות V–III מהתקופה הפרסית (סוף המאה הו'-המאה הד' לפסה"נ) נחשפו שרידי כמה רצפות, עשויות שברי חרסים ואבנים קטנות בחצי שטח הריבוע. הממצא מתאפיין בשברי מורטריות, סירי בישול וקנקנים.
בשכבה VI הובחן מילוי עשיר בשברי חרסים מהתקופות ברזל 1 והתקופה הכלקוליתית (לוקוס 313) ומתחתיו רובד אדמה חומה-צהבהבה ללא חרסים (שכבה אלוביאלית, כ-35 ס"מ עובי).
נראה כי ההתיישבות בשולי התל התקיימה בעיקר בתקופות ההלניסטית והפרסית, שבהן על פי שפע הכלים המיובאים התרחב היישוב אל מרגלות התל ושגשג. על פי הממצא העשיר מן התקופה הכלקוליתית בשדות המקיפים את התל, נראה כי היישוב בתקופה זו התרכז בעיקר במישור.