בחודשים מאי-יוני 2004 נערכה חפירת הצלה מדרום לכפר קטנה (ח' רפידייה; הרשאה מס' 4170-A*; נ"צ — רי"ח 21065/63678; רי"י 16065/13678) בתוואי גדר ההפרדה. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון משרד הביטחון, נוהלה על ידי א' זילברבוד, בהשתתפות ר' לואיס (פיקוח), ר' אבו חאלף (מנהלה), א' האג'יאן (מדידות), א' נגורסקי (צילום) וכ' הרש (ציור חרסים).
במדרון הגדה הדרומית של נחל כפירה בור מים חצוב שאותר בסקר פיתוח, נבדק בחתך באמצעות כלי מכני, ובחפירה נוקה ותועד (איורים 1, 2).
הבור סגלגל וחתכו פעמוני (3.5-4.0 × 4.0 מ'). דופנותיו ורצפתו טויחו בשכבת טיח הידראולי (14 מ''מ). בתקרת הבור נחצב פתח מלבני (לוקוס 1; 1.0 × 0.8 מ', 0.6 מ' גובה). מילוי הבור כלל שכבה מעורבת של עפר אפור ומפולת אבנים גדולות (לוקוס 2; 1.0 × 0.8 מ', 2-1 מ' גובה) ותחתיה שכבת שרפה (לוקוס 3; 0.1 מ'). על רצפת הבור הורבדה שכבת עפר (לוקוס 4; 0.5 מ' עובי), כנראה מתקופת השימוש בו ונמצאו בה שברי פכים מהמאה הא' לפסה"נ (איור 7-1:3). במילוי העליון, מתחת לפתח הבור, נמצאו שברי פך מטיפוס FBW, המתוארך למאות הז'-הח' לסה"נ (איור 8:3).
את משטח הבור תוחם במרחק 2.5 מ' ממערב קיר טרסה שכיוונו צפון–דרום ואליו ניצב קיר גדר שחצץ בין חלקות חקלאיות.