בחודשים אוגוסט–ספטמבר 2012 נערכה חפירת הצלה בשוליים המערביים של אתר יפתחאל, מצפון-מערב לתחנת השאיבה 'שמשית' (הרשאה מס' 6605-A; נ"צ 221495-2122/739956-40550), לקראת הנחת צינור מים להשקיה. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון חברת מקורות, נוהלה על ידי ח' חלאילה ור' לביא, בסיוע ל' פורת (ניהול שטח), י' יעקובי וי' לבן (מנהלה), ר' מישייב ומ' קאהן (מדידות וסרטוט) וא' שפירו (GPS).
אתר יפתחאל משתרע על מדרגה ממזרח לנחל יפתחאל בגליל התחתון, כחצי קילומטר מדרום לצומת המוביל; באתר נערכו חפירות רבות ממערב לכביש 79. בשנים 2007–2008 נערכו באתר חפירות רחבות הקף (חלאילה, מילבסקי וגצוב 2009; איור 1), ובהן נחשפו חלקים נרחבים מיישוב המתוארך לתקופות הניאוליתית הקדם-קרמית ב' (8000–7000 לפסה"נ), הניאוליתית הקרמית (6400–5300 לפסה"נ) והברונזה הקדומה 1 (3600–3300 לפסה"נ). בשנת 2010 נבדק האזור שממזרח לכביש 79 והתברר שהיישוב מהתקופה הניאוליתית הקדם-קרמית משתרע גם באזור זה (חלאילה 2011).
נפתחו תשעה ריבועים בשדה חרוש לאורך קו הצינור המתוכנן. מרכז השטח הופרע בעבר מהנחת צנרת ורק בשוליו המערביים נותרו מעט שרידים באתרם, סמוכים מאוד לפני השטח, מתחת לשכבת החריש, המתוארכים לתקופה הניאוליתית הקרמית.
בקצה המערבי של שטח החפירה אותר ריכוז של אבנים קטנות, ובו הובחן מתאר חלקי של קיר מתעגל, שנבנה מאבנים קטנות והשתמר לגובה נדבך אחד (L120; רוחב 0.4 מ'; איור 2); כנראה שרידי בית מעוגל שנבנה בציר מזרח–מערב. בתוך המבנה נחשפו בור מרוצף באבנים קטנות (L123; קוטר 0.7 מ'; איור 3) ושרידים של מתקן שנבנה באבנים ורק חלקו שרד (L122; קוטר 0.8 מ'; איור 4). בתוך מתקן 122 התגלו שרידים של כלי חרס גדול משלהי התקופה הניאוליתית הקרמית (תרבות ואדי רבה), שכנראה הונח בו. מצפון למבנה נחשפו שני ריכוזי אבנים (L112 ,L103), כנראה שרידים של בורות אשפה, ובהם כמות ניכרת של פסולת סיתות צור וגרעינים מנוצלים היטב, נתזים ראשוניים, פסולות גרעין וכן עצמות בעלי חיים. במרכז שטח החפירה נחשף בור נוסף שנחפר באדמה (לא בתכנית), והיה מלא בפסולת סיתות צור, חרסים ומעט עצמות בעלי חיים. רוב ממצא הצור שנתגלה בבורות מעורב, ומקורו בתעשייה מהתקופה הניאוליתית הקדם-קרמית ובפסולת תעשייה האופיינית לשלבים הקרמיים, דוגמת הגרעינים חסרי הצורה המנוצלים היטב. ממצא הצור מהתקופה הניאוליתית הקדם-קרמית בבורות הוא כנראה תוצאה של החריש העמוק בשדות לאורך השנים. החרסים שנתגלו סמוך למבנה ועל קרקעית הבורות הם משלהי התקופה הניאוליתית הקרמית (תרבות ואדי רבה; איור 5), והם מתארכים את הבורות לתקופה זו. שרידים מתקופה זו התגלו גם ביישוב הגדול של יפתחאל, ממזרח לשטח החפירה הנוכחי (שטח I; איור 1). בשכבת פני השטח נמצאו כלי צור וחרסים מתקופות נוספות, מתקופה הניאוליתית הקדם-קרמית ב' ולמן התקופה הרומית ועד ימינו, המיוצגות אף הן ביישוב הגדול של יפתחאל.
בחפירה נחשפו שרידי יישוב משלהי התקופה הניאוליתית הקרמית (תרבות ואדי רבה), שהשתרע עד סמוך לערוץ נחל יפתחאל הקדום. מרבית השרידים מתקופה זו נעלמו עם השנים, כנראה בשל עיבוד חקלאי של השטח, ונותרו רק מעט ממצאים סמוך מאוד לפני השטח. התרבות החומרית שהתגלתה בחפירה מתאימה לזו המוכרת מהחפירות הקודמות באתר.