בחודשים מאי-יוני 2003 נערכה חפירת הצלה מדרום למושב שילת (הרשאה מס' 3915-A*; נ"צ — רי"ח 202352-652/647000-341; רי"י 152352-652/147000-341) בעקבות עבודות פיתוח. החפירה, מטעם רשות העתיקות, נוהלה על ידי ד' סקלר-פרנס בסיוע ב"ע אמת ארצי (ניהול שטח), י' דנגור (מנהלה), צ' שגיב (צילום שטח), ו' פירסקי וו' אסמן (מדידות), א' בלשוב (שרטוט) ופועלים ממזרח ירושלים
לחפירה קדמו עבודות פיקוח שבהן נחפרו כמה תעלות בדיקה על ידי כלי מכני ונתגלה ממצא כלי צור המתוארך לתקופת הניאוליתית הקדם-קרמית א'.
החפירה נערכה בשני מוקדים: שרידי אתר פרהיסטורי ולידו שלושה ספלולים וכבשן סיד סמוך.
האתר הפרהיסטורי
נפתחו שני ריבועים (2 × 2 מ') ונמצאו פריטי צור רבים מפוזרים שמקורם כנראה מהאתר הסמוך כ-15 מ' מערבית לחפירה שנהרס מעבודות הפיתוח בשטח.
שלושה מטרים מצפון לשטח החפירה נחשף משטח סלע ובו חצובים שלושה ספלולים. לגדול חתך קוני (0.31 מ' קוטר, 0.3 מ' עומק, איור 1:A), לידו נחצב ספלול רדוד (0.3 מ' קוטר, 0.1 מ' עומק, איור 1:B) לידו ספלול שלישי קטן (0.16 מ' קוטר, 0.08 מ' עומק, איור 1:C). ייתכן ששני הספלולים הגדולים שימשו מתקן סחיטה.
כבשן הסיד (איור 2)
250 מ' מצפון לאתר נחשף כבשן סיד עגול (6.1 מ' קוטר) שדופנותיו חצובות בחלק התחתון ובנויות אבני גוויל בחלק העליון, שהשתמר לגובה שבעה נדבכים (1.4 מ'). סביב הכבשן נמצאו אבנים שרופות ואדמה מעורבת באפר שיצרו טבעת פסולת (1.6 מ' רוחב). בתוך הכבשן נמצאו שכבות של אבנים ומילויים שהכילו סיד, פחם, אפר וממצא מודרני. לא נתגלה ממצא המתארך את זמן בניית הכבשן.