שכבה II. נתגלו שני בורות (1, 2) ותעלת ניקוז (L250) החצובים בסלע הגיר (איור 3). בור 1 אגסי (1.9 מ' רוחב, 1.7 מ' עומק) ופתחו לא רגולרי (0.9 × 1.3 מ'). הבור היה מלא בשכבות של אדמה חומה (L209 ,L206), שהכילה חרסים רבים המתוארכים לתקופה הממלוכית.

בור 2 עגול (כ-1 מ' קוטר הפתח, 1.4 מ' קוטר, 1.5 מ' עומק; איור 2). הבור היה מלא בשכבות (L210) של אבני גוויל ואדמה חומה, שהכילה שברי כלי חרס מהתקופה הממלוכית ושבר של אבן רחיים ביתית מבזלת (איור 4). מתחת למילוי 210 ועל קרקעית הבור נחשפה שכבת אדמה חומה דקה ובה אפר (L212), שהכילה חרסים מהתקופה הממלוכית, בהם פך (איור 1:5) ונר תמים (איור 2:5).
תעלת הניקוז לא רגולרית (0.5–0.9 מ' רוחב, כ-0.7 מ' עומק), פתוחה וחצובה בסלע. כיוונה דרום-מזרח–צפון-מערב, והיא התחברה אל חלקו העליון של בור 2. בתעלה היה מעין בור שיקוע (L211) שככל הנראה שימש לתחזוקת התעלה, ממנו נחצב מעין צינור בשיפוע (0.10–0.15 מ' קוטר) שחיבר בין בור 211 לבור 2 (איורים 2, חתך 1–1; 6). תעלה 250 ניקזה כנראה מערכת מים של בית מגורים סמוך ששרידיו לא נשתמרו.
בתוך שכבות המילוי של הבורות ובתעלת הניקוז נמצאו חרסים שתוארכו לתקופה הממלוכית, בהם צלחת מיובאת (איור 1:7), צלחות מזוגגות בצבעים כחול ולבן מבית ייצור בסוריה (איור 2:7–4) המתוארכות למאות הט"ו והט"ז לסה"נ, צלחות מזוגגות בצבעים כחול ולבן מתוצרת מקומית (איור 5:7) וקערה מזוגגת בצבעים צהוב וירוק (איור 6:7) המתוארכות למאות הי"ג והי"ד לסה"נ, קערה מזוגגת שלה רכס חיצוני מתוצרת איטליה (איור 7:7) המתוארכת למאות הי"ד והט"ו לסה"נ.
 
שכבה I. נחשף קיר (W204, כ-5 מ' אורך, 0.8 מ' רוחב; איורים 2, 3), בכיוון צפון–דרום, שנשתמר לגובה שני נדבכים. הקיר נבנה מאבני גיר, חלקן מסותתות סיתות גס, והושתת מעל שכבת מילוי של אדמה חומה (L205 ,L202; כ-0.8 מ' עובי) שהושתתה על פני הסלע, שרידי הבורות ותעלת הניקוז. בתוך המילוי של שכבה I  נמצאו חרסים מהתקופות הממלוכית והעות'מאנית ושבר מקטרת מהמאה הי"ז לסה"נ (איור 8).
 
ממצא עצמות בעלי החיים
נמרוד מרום
 
החפירה בא-ריינה העלתה מספר קטן של עצמות מזוהות (9=N) ממילויים בבורות ובתעלה 250 שתוארכו לתקופה הממלוכית וכן ממילויים החותמים אותם ומשמשים תשתית לקיר מהתקופה העות'מאנית (12=N). בין השרידים היו עצמות צאן (24%, 5=N), בקר (52%, 11=N) וסוסים (24%, 5=N). שן אחת זוהתה כשן סוס ושן אחרת כשן חמור.
ייצוג חלקי השלד (טבלה 1) מתאפיין בדומיננטיות יחסית של עצמות גפיים תחתונות ושיניים. על שתיים מהעצמות נראו סימני לעיסה, ככל הנראה של כלבים, אך לא נצפו סימני חיתוך. למעט שן בקר אחת של פרט צעיר, כל יתר השרידים מייצגים בעלי חיים בוגרים. המכלול אינו מלמד רבות על כלכלת היישוב בתקופה האסלאמית המאוחרת, שכן נראה כי העצמות מייצגות בעיקר פסולת שחיטה של בהמות עבודה מבוגרות שהושלכו בפאתי היישוב והוזזו מאוחר יותר לצורכי מילוי לבנייה.
 
טבלה 1. התפלגות חלקי השלד במכלול
חלק שלד
צאן
בקר
סוסיים
שיניים
 
3
2
חוליות
2
 
1
רדיוס
 
 
2
טיביה
1
1
 
קלקנאוס
 
2
 
אסטרגל
 
1
 
עצמות כף (מטפודיאל)
2
1
 
אצבעות
 
3
 
סה"כ
5
11
5
  
בחפירה נתגלו שני בורות ותעלת ניקוז מהתקופה הממלוכית, שהיו כנראה חלק ממכלול בנייה שלא נשתמר. בשכבה I נחשף קיר שהשתייך כנראה למכלול בנייה מהתקופה העות'מאנית ולא נשתמר. לחפירה חשיבות רבה, כיוון שלראשונה התגלו עדויות לקיומו של יישוב מהתקופה הממלוכית בכפר א-ריינה. כלי החרס המיובאים הרבים מעידים על מצב כלכלי טוב של תושבי הכפר.